祁门县中医医院自1986年建院以来，围绕"中医为本，质量至优，精诚服务，惠泽民众"宗旨，坚持"以病人为中心、充分发挥中医药特色，做仁医施仁术"服务理念，历经三十余年，现已发展成为集医疗、科研、教学和中医技术指导于一体的一所综合性二级甲等中医医院。
医院占地20467.37平方米，医疗用房总面积12452.34平方米。目前医院编制床位为180张，六个病区实际开放床位为239张，平均住院病人达到170余人，在职职工235人，高中级技术人员90余人。科室设置齐全，诊疗科室有内科、外科、妇产科、儿科、眼耳鼻喉科、皮肤科、骨伤科、针灸康复科、麻醉科、肛肠科、急诊科、体检科；医技科室有放射科、CT室、检验科、胃肠镜室、超声心电科、脑电图室、碎石科、病理科、输血科、消毒供应室、药械科；职能科室有院办室、人事科、医务科、科教科、护理部、院感办、网管中心、农合办、医保办、门诊部、财务科；后勤保障有总务科、设备科、保卫科等。诊疗设施齐全、设备精良，除中心供氧及常规配置外，还配备有螺旋CT机、CR、LEEP刀、电子肠胃镜、全自动生化、彩色多普勒、腹腔镜等先进诊疗设备和系列中医康复理疗设备。
随着医院整体素质的提高和社会信誉的逐渐增强，以及医保、新农合工作的顺利开展，医院服务半径、诊疗范围也逐渐扩大，科室的应急能力和处理急、危、重、疑难病人的综合能力得到提高，并独具中医特色。骨伤科、针灸康复科发挥中医特长，在颈肩腰腿痛、中风后遗症等疾病治疗上取得了明显疗效。大力推广和开展针灸、火罐、推拿、熏蒸、中药外敷、刮痧等中医特色诊疗技术，中医特色科室已在当地形成影响，业务量逐年增加，社会效益不断提高。
科学的管理、可靠的技术、优质的服务，加上独具特色的中医药优势，得到了社会的普遍认可。该院是省卫生厅确定的针灸理疗康复中医特色技术推广建设单位、安徽中医学院新安医学研究基地、安徽中医药大学第一附属医院和省立儿童医院医联体单位。目前有全国基层名老中医药专家传承工作室1个，骨伤科和针灸科是省级重点特色专科，肛肠、糖尿病是市级重点专科专病。医院先后被评为"骨伤特色医院"、"爱婴医院"、"二级甲等中医医院"、"全省示范中医院"。先后荣获"安徽省十佳中医院"、"全省百家最佳优质服务单位"、"市文明窗口单位"、"省巾帼文明岗"和中华全国总工会授予"模范职工小家"等称号，近年来多次在县"三位一体"窗口单位年度评比中名列前茅。随着医院管理步入信息化、数字化、科学化，医院综合服务能力不断提升，医院将得到持续稳步发展，以满足人民群众日益增长健康需要。
