阜南县人民医院始建于1949年，1950年改建为阜南县卫生院，1966年定名为"阜南县人民医院"，1996年被评为二级甲等医院，2020年成功创建三级综合医院，2023年加入阜阳师范大学附属医院。几代人秉持"纪律严明业精品高诚实规矩廉洁高效"的医院精神，经过七十余年的不懈追求，已发展为集医疗、预防、科研、教学为一体的三级综合医院。先后被授予"全国卫生计生先进集体"、"全国医疗卫生改革示范医院"、"阜阳市五星级标准化党组织"等荣誉称号。
医院设有37个临床专业科室（44个病区），16个门诊医技专业科室，编制床位1200张。现有在职职工1683人，其中高级职称252人。呼吸与危重症医学科为国家PCCM建设三级达标单位，呼吸与危重症医学科、医学影像科、神经内科为阜阳市"十四五"重点专科。医院紧抓"五大中心"建设契机，依托MDT诊疗模式，建立起以病种为单元的"一站式"多学科诊治中心，实现了各学科资源的优化整合，大幅提升了医疗救治能力和服务水平。其中，卒中中心被国家脑防委评选为"国家示范卒中防治中心"、被安徽省脑血管专科联盟委员会评选为"五星防治卒中中心"。在最新公布的全国三级公立医院绩效考核中，阜南县人民医院位列全市第三，其中医疗质量、四级手术人数排名、群众满意度评价等指标均位于前列，是全市进步最快的三级医院。医院始终坚持多元发展、靠大联强，积极引进优质医疗资源，建设完成了以上海市东方医院刘俊教授名医工作室为主导，"北京301医院温朝阳教授名医工作室"、"上海瑞金医院谢玉才教授名医工作室"互为支撑的心脏疾病诊疗闭环体系，让群众不出县即可享受北京、上海心脏疾病诊断治疗团队同质化、平移式的优质医疗服务。
阜南县医院城北新区于2024年1月28日正式开诊，设有1480张病区床位和1000张医养中心床位，新院区环境优美、交通便利，衔接阜阳阜南同城化发展，毗邻南阳大道和阜南新客运中心，占地294.3亩，总建筑面积27万平方米。
新区急救中心采用"院中院"设计理念，能够实现接诊、急救、检查、手术全流程、一站式保障。配备完备的检验、CT、放射、超声等辅助功能区，并引进了全球领先的德国西门子3.0T超高场磁共振，全球顶级256排512层超高端能谱CT，在整个检查过程中，无需病人刻意配合，就能获得优异图像，能够"更高、更快、更广"地进行个性化扫描，为临床诊疗提供更精准导航。
站在新的历史起点上，在县委、县政府的坚强领导和大力支持下，阜南县人民医院将以崭新的院区环境、崭新的发展格局、崭新的精神面貌，统筹推进三级公立医院绩效考核、三甲医院创建等中心工作，以高质量党建引领推动医院高质量发展不断取得新进展，为阜南及周边人民群众提供更为优质高效的、覆盖全生命周期的医疗卫生服务。
