亳州市华佗中医院始建于1956年，2000年获批"二级甲等中医医院"，是安徽省"北华佗、南新安"中医发展战略的重点建设单位。
医院中医药文化传承，州市华佗中医院是亳州市谯城区卫健委直属的，集名医堂、医疗、教研、防保为一体的二级甲等中医医院。医院拥有职工407人，其中中高级专业技术人员近百人，设有国医堂专家门诊和内科、外科、儿科、骨伤科、妇科、心脑血管专科、糖尿病专科、口腔科、耳鼻喉科、乳腺专科、呼吸科、皮肤科、针灸科、推拿科等多个门诊科室，目前开设内科、外科、妇产科、儿科、急诊科、骨伤科、肝病科、重症医学科等9个病区，医技科室6个，开放床位300张。医院科室设置齐全，中医特色氛围浓郁，医疗设备完善。
医院突出中医药优势，设立国医堂、名医工作室，其中医院"国医堂"设有国家级中医药师承指导工作室1个(本院名老中医杨从鑫)，2个省级名中医工作室，市级名中医工作室6个，市级青年名中医工作室1个。医院目前有省级重点专科、市级重点专科各1个。开展耳穴埋豆、穴位贴敷、火疗、中药熏蒸、针灸、针刀、推拿、点穴、刮痧、拔罐等中医药适宜技术60余种。亳州市华佗中医院坚持和发扬"厚德精术崇古尚今"的院训，深入贯彻"以病人为中心"的理念，突出中医特色，以全新"治未病"的医疗服务理念为人民群众提供养生、康复、医疗、保健等服务，形成完善的中医药预防健康体系，不断提高医院服务能力和水平，推动医院全面协调发展。
医院科研成果：我院将全力推进胸痛、卒中、创伤三大中心及医共体科教培训中心建设，依托中科大附属第一医院、安徽省中医院等上级单位，积极联系长三角优质医疗资源，不断开展临床各科室共建，不断提升基层服务能力，提高区域危重症救治能力。2020年12月我院被中共安徽省委、安徽省人民政府评为"安徽省抗击新冠肺炎疫情先进集体"；2020年2月我院被中共亳州市委亳州市人民政府评为"亳州市新冠肺炎疫情防控工作先进集体"；2020年5月我院抗疫医疗组被共青团亳州市委员会、亳州市青年联合会评为"亳州青年五四奖章集体"；12月被亳州市精神文明建设指导委员会评为"第九届亳州市文明单位"。医院努力完善科研教学管理规章制度，部分科研项目顺利完成结题，科技创新成果喜人。获安徽省中医药科技奖三等奖2项，获亳州市科技进步奖二等奖1项、三等奖2项。
从头迈步越新天，在市、区领导的带领下，亳州市华佗中医院将进一步坚持中医特色，立足于亳州市"世界中医药之都"的发展定位，助力"健康亳州"建设，创新发展思路，继续完善基础设施建设，亳州市华佗中医院正积极探索具有中医药特色的现代化中医院发展之路。
