亳州市中医院起始于1956年，成立于2019年4月，是一所集中医医疗、教学、科研于一体的三级甲等中医医院，位于华佗故里、中华药都、国家中医药传承创新发展实验区亳州，是国家中医特色重点医院、省级区域医疗中心及省级中医医疗中心建设单位，安徽省中医药文化宣传教育基地，是安徽中医药大学教学医院，安徽中医药大学第一附属医院亳州分院，亳州学院附属医院。2022年度国家三级公立中医医院绩效考核获得"B+"等级，位列全国第199名。2024年，医院门急诊人次56.3万，出院人次4.1万。
医院坐落于亳州市谯城区北一环与魏武大道交叉口，总占地135亩，建筑面积约18.9万平方米。目前医院职工1132人，其中卫生专业技术人员1046人，正高级职称46人，副高级职称159人，研究生123人。拥有全国老中医药专家学术经验继承工作导师1名、全国各类中医药优秀（骨干）人才8人、硕士研究生导师2人、江淮名医2名、安徽省名中医2名、安徽省基层名中医1名。
医院设有临床科室31个，医技、医辅科室12个，已创建标准版胸痛中心、综合卒中防治中心。目前拥有"国家中医药管理局农村医疗机构中医特色优势重点专科"1个，省级重点专科专病7个、市级重点专科15个，各级名老中医工作室10余个。2024年5月，肺病科、眼科入选国家中医优势专科建设项目，急诊科入选国家中医优势专科培育项目。近3年，医院共开展省、市级科研项目110余项，取得实用新型发明专利10余项。
立足于亳州市"世界中医药之都"的发展定位，亳州市中医院以人民群众健康为中心，始终秉承"群众满意，医患关系更和谐；职工满意，员工更具幸福感；社会满意，彰显责任与公益"的使命，以"中医有特色，西医有优势"的医院发展理念，不断提升核心竞争力，朝着全国知名、全省一流的中医院努力奋进。
